根据测算，地铁5号线将是南京线网中日均客流强度最高的线路。因为其沿线串联东山副城、土山机场、南部新城、夫子庙地区中心、莫愁商业街、五台山体育中心、北京西路行政中心、山西路—湖南路商业街和下关滨江商务区，覆盖主城最为密集的客流集散点，也能缓解主城最为拥堵的中山北路、升州路和建康路段交通压力，方便沿线居民出行。

　　南京地铁集团在给邱冬的答复意见书中称：南京地铁建设指挥部在5号线方案研究过程中本着尽量避让文物的原则开展了研究，其中多处涉及文物的方案进行了充分的研究比选，从保护文物的角度进行了方案调整，如三山街站站位整体南移，避让北侧净觉寺及区级不可移动文物(增加拆迁21000平方米)。下关站站位整体南移避让渡江胜利纪念碑本体等。答复意见书中还特别提及，环评单位将5号线环评范围设为沿线200米，此前南京地铁3号线和4号线范围设为150米。

　　答复意见书还称，因地铁5号线外部条件十分复杂，局部线站位调整空间非常有限，目前工程方案仍涉及需上报审批的文物保护单位22处(23个点)，其中包括原国民政府最高法院旧址等3处(4个点)全国重点文物保护单位，渡江胜利纪念碑等6处省级文物保护单位，13处市、区级文物保护单位和不可移动文物；同时沿线涉及地下文物重点保护区6处。

　　南京地铁还强调，针对这样的情况，一方面将组织方案研究单位进一步研究，如通过压低下穿文保单位段线路埋深、采取特殊减振等措施以减少影响，对于地下文物重点保护区，请相关负责单位制订考古工作方案；另一方面也将在文物主管部门的指导下严格按照《中华人民共和国文物保护法》等法规，开展工程后续研究、建设等工作。

　　5号线30个站点>>>

　　方家营、南京西站、建宁路、下关、盐仓桥、福建路、虹桥、山西路、云南路、五台山、上海路、朝天宫、三山街、夫子庙、大中桥、光华门、小天堂、七桥瓮、机场路、大校场、岔路口、城北路、上元大街、新亭路、竹山路、科宁路、前庄路、诚信大道、东大九龙湖、将军路