南区与中区隔街相望，原设计为三路，其中东路建成于民国十三年（1924年），而中、西二路仅将大门及临街房建成，后因时局变化，尚未建成。

南区东路座南向北，亦为九门相照，前后四个四合院。其中头进院和三进院较小，分别建二门、三门，门两侧各为两间廊房，东西厢房各为三间；二进院和四进院较大，其正房均为七间，东西厢房各为五间。

南区的建筑规模和规格，都明显高于中、北二区，这不仅表现在建筑体量的增大，大门的增多，而且表现在精美的石、砖和木雕建筑物件的大量使用。究其原因，南区为民国时期所建，已不再受封建社会的种种规定和限制。马氏四兄弟分家时，分给老三马吉梅。

庄园建筑全为砖木结构，灰瓦盖顶。屋顶多为硬山顶式，另有悬山及平顶等。其建筑特点既有北京传统四合院特色，又有中原地方民间建筑特色，又兼有山西雕刻艺术特色。另一显著特点是，无论正房，配房大多有前廊，有的则前后带廊，形成廊廊环绕，院院相通，尤其是雨雪天便于行走。

马氏庄园大门

马氏庄园大门外的东西券门上方，高悬着两块匾额：“惩忿窒欲”“致虚守静”。“惩忿窒欲”，源于《易经》的第四十一卦“损卦”：“象曰，山下有泽，损，君子以惩忿窒欲。”“惩忿”，意指去除心中愤怒，严于律己，宽以待人；“窒欲”，就是要抑制无限欲望，清心寡欲，无欲则刚。此匾旨在告诫马氏后人，不强求，不奢求，淡然就好。

和“惩忿窒欲”匾额相对的是“致虚守静”匾。“致虚守静”四字出自老子的《道德经》：“致虚极”“守静笃”。“致虚极”就是要去除杂念与污染，空明一片，湛然朗朗。“守静笃”讲的是，要一心不乱、专一不二地“守”住平静之心，宁静致远。

北区位于中街路北，坐北朝南，前后两个四合院，后院之东西又各建一跨院，谓之“亚元扁宅”。多为硬山顶式的楼房，原为马丕瑶祖上旧宅。马氏四兄弟分家时，分给了次子马吉樟。民国初年，马吉樟任袁世凯总统府内史期间进行了翻修和改建。在马氏庄园北区大门正上方悬挂的是“进士第”匾额。马丕瑶同治年间考中进士，官方为他做了这块匾额。右边的“大总裁”指科举时候的主考官，下面刻写他们的官职和姓名。左边是马丕瑶科考的成绩，他在殿试中的成绩是第三甲第二十名，朝考（清代新科进士取得出身后，仍然参加一次朝廷的考试，特派朝中大臣阅卷，故称“朝考”）的成绩是第三等第十七名。

青出于蓝而胜于蓝。第二块匾额“太史第”是马丕瑶次子马吉樟科考的成绩及官职。他殿试的成绩是第二甲第三十七名，赐进士出身，朝考第二等第七名，授职（翰林院）编修、国史馆协修。