第五进庭院

从棂星门至大成门为第五进庭院。棂星门的四棵中金柱穿屋顶而出，高出屋脊两米余，柱顶上罩明代盘龙青花瓷罩，下段裸柱上有木制饰物，这是全国文庙中罕见的建筑形式。五进庭院正中是专为纪念孔子办学设教建造的杏坛，内用斗八藻井，瓦用黄色琉璃瓦，彩绘金龙和玺，规格很高。坛内竖明代“孔圣弦诵图”石碑。杏坛左前有奎星阁；左后有名宦祠、金声门，右后有乡贤祠、玉振门。奎星阁、文昌阁供奉“奎星星君，文昌帝君”，取“奎主文章，魁星点斗，文运昌盛”之意。乡贤名宦祠是为祭祀建水古代有名望的乡绅、贤人和纪念古代建水籍在外地做官的名人而建的祠堂，属于地方文庙的特有建筑。

第六进庭院

大成门以内至先师殿及两庑两耳围合的第六进庭院空间，是文庙的核心和重点。此庭院由大成门、先师殿（大成殿）、东西两庑、东西碑亭、东西两耳组建成气势恢宏、格调高雅、金碧辉煌的方形建筑群体，营造出文庙特有的建筑意境。院内还有相传植于元代的古松、古柏，植于明代的山茶和植于清代的金银桂。院内的一对伏坐石雕白象，上驮一米多高的青铜花瓶，其造型体现了中原文化、边陲文化和东西亚文化的交相辉映，取意为“象呈升平”。

建水文庙·先师庙

第七进院落

大成殿至崇圣祠为第七进院落，崇圣祠是祭祀孔子前五代列祖列宗的场所，其为五开间三进深单檐歇山顶抬染式建筑，通面阔24米，进深16.5米，高9米，占地396平方米，前檐梁架、斗拱上施彩画，图案精美、色彩古朴，殿前有石拦板望柱（拦板24块，望柱26棵），石拦板上刻有西湖24景名胜图。在大成殿庭院东西两侧，还有体现“庙学合一”的东西明伦堂。崇圣殿东侧有二贤祠和仓圣祠。二贤祠是乡人纪念明洪武年间被贬谪至文庙讲学十余年的两位文人学士而建的祠堂。仓圣祠是祭祀我国古代发明者仓颉的场所。祠后还有象征“孔林”的古柏树林，使文庙更添庄严古雅之色。