2000年5月，三明市委托中国文化遗产研究院编制《万寿岩旧石器时代遗址总体保护规划》，并通过国家文物局批复，确定了遗址保护利用的总体目标任务。2003年至2010年先后完成了第一至三期保护工程，通过了国家文物局验收。2013年初，三明市委、市政府决定将建设万寿岩国家考古遗址公园，展开了新一轮的遗址保护与利用工作，加大遗址周边环境整治力度，恢复山形，恢复生态。为更好地展示万寿岩遗址的保护成果，2016年三明市投资近千万元兴建了福建省唯一的旧石器遗址专题博物馆，并举办了中科院古脊椎动物学与古人类学国际学术研讨会。

万寿岩的保护之路给予了三明启示。如今，三明的文物保护已经走上了法制化。今年3月1日起，《三明市红色文化遗址保护管理办法》正式施行。《办法》将习近平总书记关于“保护好红色资源、发扬好红色传统、传承好红色基因”的重要指示精神落到实处，是我省首部专门针对红色文化遗址保护进行立法的政府规章，也是三明市政府制定出台的第一部实体性政府规章，标志着三明市红色文化遗址保护走上法制化管理轨道。下一步，三明还将在建立红色文化遗址名录、促进红色文化资源保护与历史文化名镇名村的相互融合、策划包装文物保护项目上做足文章，力争更多项目列入上级项目盘子，进一步推动红色文化遗址及文物保护工作制度化、常态化。